FSL teszt

Kutatócsoportunk mágneses rezonancia képanalízissel foglalkozik az FSL programcsomag segítségével. Tekintettel arra, hogy a felvételek analízisének jelentős része voxelenként, egymástól függetlenül történik az eljárások jól parallelizálhatók. Az Oxfordi Egyetem FMRIB csoportja által fejlesztett FSL softvercsomag grid engine detektálása esetén a számításokat automatikusan parallelizálva indítja el. 

Jelen pilot project célja az, hogy megvizsgáljuk, hogy az MTA Cloud alkalmas-e a fenti programcsomag és analízisek futtatására. 

Ahogy azt Kacsuk Péterrel történt megbeszélésünkön megegyeztünk kezdetben ezt egy 10 CPU-s hozzáféréssel egy hónap alatt tesztelnénk. Siker esetén esetleg több processzort, a későbbiekben pedig akár GPU-t is igénybe szeretnénk venni. 

Bár nem akadémiai kutatóközpont vagyunk, a javasolt pilot teszt több izgalmas project előtt nyitná meg az utat. Reméljük, hogy a tesztfázis futtatásának akadálya nem lesz. 

Az FSL programmal kapcsolatos információk a következő linkeken érhetők el:

https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/

https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslInstallation

https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FslSge

 

 

Contact information for project leader
Kincses Zsigmond Tamás
MTA Támogatott Kutatócsoportok Irodája