A Magyarországi SARS-CoV-2 járvány eredetének genomi epidemiológiai modellezése

A harmadik projekt is elindult az MTA Cloudon az új koronavírus (SARS-COV-2) okozta járvány (COVID-19) elleni küzdelem támogatására. A Pécsi Tudományegyetem Szentágothai Kutatóközpont kutatói a járvány kezdete óta vizsgálják a vírus genetikai változásait. Ezen adatok megfelelő számítási kapacitással és algoritmussal történő elemzése a vírusok evolúciós, tér-időbeli terjedési kapcsolatait képes feltárni. A járvány kezdetének ilyen irányú vizsgálata választ ad a hazai terjedés dinamizmusára és jellemzőire. A hazai járvány tekintetében egyelőre nem készült ilyen elemzés.

Tehát a hagyományos diagnosztikai adatokon túl ez az eljárás választ tud adni:

  -  a vírus hazai tér-időbeliségére
  -  a vírus országba történő megjelenésének forrására
  -  az országon belüli terjedés irányára és mértékére
  -  bizonyos genetikai változások dominanciájára és terjedésére

Az MTA Cloud használatával és a SZTAKI kutatóinak támogatásával 50-szeresére gyorsult az alkalmazott algoritmus végrehajtása.

Projektvezető: Dr. Kemenesi Gábor

Szentágothai János Kutatóközpont

Dátum: 2020. 04. 22.